Diajukan Untuk Memenuhi Nilai Tugas Kelompok Mata Kuliah Kimia Organik. Dosen Pengampu Ir. Ir. !j. "ah#uningsih$ M.Si Disusun Oleh % . S e p t i K u s u m a A s tu t i ' . ! e n i t i # a "i # a s t i t i ) . "i 1 i t A# u Ap r i l ia ia n a
P2O32AM STUDI DIP4OMA III TEKNIK KIMIA SEKO4A! 5OKASI UNI5E2SITAS DIPONE3O2O SEMA2AN3 '(%0
1
DA6TA2 ISI
Halaman Sampul.................................................................................................................. i Daftar Isi............................................................................................................................... ii Biosintesis Peptida.............................................................................................................. 1 I........................................................................................................................ Tujuan Pem7elajaran ......................................................................................................................... % II...................................................................................................................... Uraian Materi ......................................................................................................................... %
Tujuan Pem7elajaran Mahasiswa dapat mendeskripsikan sintesis dan iosintesis peptida. II. Uraian Materi '.% Biosintesis Peptia Peptia me rup aka n
mo le ku l
!a n"
t er e nt uk
da ri
d ua
a tau
leih asam amino. #ika $umlah asam amino masih di awah %& molekul diseut peptida' namun $ika leih dari %& molekul diseut den"an protein. (sam amino salin" erikatan den"an ikatan peptida. Ikatan peptida ter$adi $ika atom nitro"en pada salah sa tu asam amino eri katan den"an "u"us karoksil dari asam amino lain. Peptida terdapat pada setiap makhluk hidup dan erperan pada eerapa akti)itas iokimia. Peptida dapat erupa en*im' hormon' antiiotik ' dan reseptor .
+1 ,
Biosintesis peptida dan protein dalam suatu sel !an" khas dilaksanakan oleh asam rionukleat R(/ dan en*im. Bera"ai tipe R(' seperti R( pesuruh mR(/' disintesis di awah pen"arahan D( dalam inti sel. 0emudian molekul-molekul R( ini akan menin""alkan inti sel untuk melakukan fun"si-fun"sin!a. Bila mR( menin""alkan inti' molekul ini melekat pada riosom' !akni utiran-utiran pada sitoplasma sel !an" merupakan letak-letak sintesis protein. Suatu Riosom terdiri dari & R( riosomal rR(/ dan 4& protein. 3iap asam amino diawa ke mR( dan riosomn!a sea"ai suatu ester dari satu satuan riosa dalam suatu molekul R( transfer tR(/. Biosintesis peptida dilaksanakan oleh R( dan en*im' den"an tahap-tahap sea"ai erikut a. D ( me n5 eta k mR ( !a n" m ema wa k odon ur ut an- ur uta n 6 asa nitro"en/ selan$utn!a mR( akan ke R( riosom untuk dilakukan perakitan asam amino-asam amino men$adi peptide atau protein. . R(transfer akan memawa asam-asa m amino untuk dirakit di R(riosom sesuai den"an 5odon !an" diawa mR(.
1
3am7ar ' . Biosintesis suatu peptida a/ fM et ' atau N - formilmetionina asam amino pemrakarsa den"an kodon
(78/' telah terikat pada a rg kodon 98(/. (sam amino erikut !an" akan ditamahkan adalah ph e kodon 777/. Rantai peptida !an" sedan" tumuh itutelah ditransfer ke ph e . 5/ Riosom telah er"erak men!usuri rantai mR( ke kanan/' sehin""a rantai peptida dapat ditransfer ke asam amino erikutn!a' lys kodon ((8/.
8ontoh 2eaksi Sintesis
(:B;9 Dalam persamaan ini' huruf ( dan B mewakili reaktan !an" memulai reaksi' dan huruf 9 merupakan produk !an" disintesis dalam reaksi. Panah menun$ukkan arah di mana reaksi ter$adi.
< (pa persamaan kimia untuk sintesis nitro"en dioksida = 2/ dari
oksida nitrat =/ dan oksi"en = 2/>
( Persamaan untuk reaksi sintesis ini adalah
2= : =2 ; 2=2 9ontoh lain dari reaksi sintesis adalah kominasi dari natrium a/ dan klorin 9l/ untuk men"hasilkan natrium klorida a9l/. Reaksi ini diwakili oleh persamaan kimia 2a : 9l2 ; 2a9l
2
atrium adalah lo"am !an" san"at reaktif' dan klorin adalah "as era5un. 0edua unsur di"amarkan pada 8amar di awah. Sen!awa !an" mereka sintesis memiliki sifat !an" san"at ereda. atrium klorida !an" iasa diseut "aram me$a' !an" tidak reaktif atau era5un. Bahkan' "aram adalah komponen pentin" dari makanan manusia. '.'
2eaksi92eaksi Biosintesis Peptia
(nthranilate menerima phosphorios!l dari PRPP. Penataan ulan" dari riosa' dekaroksilasi' dan 5in5in tertutup !an" men"hasilkan indole "liserol fosfat. Horton.2&&/
Dua reaksi akhir dari iosintesis triptofan dikatalisis oleh tr!ptophan s!nthase. Dalam eerapa or"anisme ' dua domain katalitik independen sintase tr!ptophan terdapat pada rantai polipeptida tun""al . Pada or"anisme lain ' en*im terdiri dari dua $enis suunit dalam tetramer ?2@2 . Suunit alfa atau domain men"katalisis pemelahan indole "liserol fosfat men$adi "liseraldehida 6 - fosfat dan indole . Suunit eta atau domain men"katalis kondensasi indole dan serin dalam reaksi !an" memerlukan PAP sea"ai kofaktor . Indole !an" dihasilkan dalam reaksi' dikatalis oleh alfa suunit tetramers ?2@2 3
kemudian disalurkan atau ditransfer lan"sun" ke situs aktif dari suunit @ . 0etika struktur ti"a dimensi dari sintase triptofan dari Salmonella t!phimurium or"anisme sintase triptofan !an" memiliki struktur oli"omer ?2@2/ ditentukan den"an kristalo"rafi sinar- ' ditemukan seuah terowon"an tempat er"aun"n!a situs aktif ? dan @. Diameter terowon"an sesuai den"an dimensi molekul indole ' $adi a"ian dari indole !an" melalui terowon"an akan men$elaskan men"apa indole tidak erdifusi.
4
DA6TA2 PUSTAKA
(nonim. 2&1C. Metaolisme Makanan (mino (5id httpssites."oo"le.5om sitemetaolismemakananamino-a5id-metaolism.
Diakses
1%
o)emer 2&1C (nonim. 2&1C. Peptida. httpsid.wikipedia.or"wikiPeptida . Diakses 1% o)emer 2&1C Eessenden' Ralp # dan Eessenden #oan S. 1FG2. Kimia Organik Edisi Ketiga. #akarta rlan""a. Hisham. 2&1%. Pen"ertian dan 9ontoh Reaksi Sintesis. httphisham.id2&1% 1&pen"ertian-dan-5ontoh-reaksi-sintesis.html. Diakses 1% o)emer 2&1C