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UNVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA-SEDE MEDELLÍN ESCUELA DE QUIMICA ASIGNATURA ASIGNATURA BIOQUÍMICA
TALLER DE ENZIMAS
1. Para cada una de de las las siguient siguientes es enzimas enzimas,, escriba escriba con estructuras la reacción que cataliza: a.
Treonina deshidratasa
h. Tirosina fosfotransferasa
b.
Asparagina hidrolasa
i. Prolina recemasa
c.
Aspartato amonioliasa
j. Treonina epimerasa
d.
Glutamato descarboxilasa
. !iste"na, #$G#aminotransferasa
e.
Glutamina sintetasa
l. Gl Glutamato deshidrogenasa
f.
!iclohexanol deshidrogenasa
m. Glicerol quinasa
g. %enzoato de metilo hidrolasa
&.
'sando estructuras orgnicas sencillas escriba escriba reacciones reacciones qu"micas qu"micas que podr"an ser catalizad catalizadas as por las siguientes enzimas (dos reacciones en cada literal):
a. *iasa *iasa +
oxigen oxigenasa asa
b. Glucos Glucosida idasa sa c.
e. utasa utasa
h. eshid eshidrat ratas as e hidrol hidrolasa asa
+ quinas quinasa a
Pirofosf Pirofosfatasa atasa +
d. *ipasa *ipasa +
f.
n. !atalasa
pirofosfor pirofosforilas ilasa a
descarboxi descarboxilasa lasa +
/pimer /pimerasa asa
g. esami esaminasa nasa
i.
-intet -intetasa asa + sintas sintasa a
j.
Aminotrans Aminotransferas ferasa a + transcetol transcetolasa asa
.
eshidrogen eshidrogenasa asa e hidroxila hidroxilasa sa
oxidasa oxidasa
l.
!arboxilas !arboxilasa a + fosforil fosforilasa asa
+
m.
Perox Peroxid idasa asa + dioxig dioxigena enasa sa
n.
0acema 0acemasa sa + ligas ligasa a
fosfat fosfatasa asa +
reduct reductasa asa
. /scriba el no!"re co!#leto de cada una de las enzimas del punto anterior. anterior.
2. !onsidere las siguientes reacciones$
a.
b.
CH3CH2OH + NAD+
CH3 C COOH O
CH3CHO + NADH +
CH3 C O
H
CO2
2
O c.
H2 N
CH
C
NH
CH
COOH
H2O
H2 N
CH2OH
CH3 CH
CH
COOH
PO
O
PO
PO
O e.
O
O ADP
ATP
O C
O -
COO
-
CO2 ATP + H2O
g.
COOH
CH3
d.
CH3
CH
CH2OH
CH3 CH
CH3
f.
H2 N
H2 N CH COOH CH OP CH3
H 2O
OOC
CH2
C
-
COO
ADP + Pi
H2 N CH COOH CH OH
Pi
CH3
2.1. Para cada reacci3n identifique el no!"re + el n%!ero de la CLASE de la enzima que la cataliza. 2.&. /scriba el no!"re co!#leto para cada enzima.
4.
5u6 &racción 'e la VMA( es la 7elocidad de una reacci3n enzim8tica que sigue la cin6tica de #, cuando: a. 9s ; $ c. 9s ; <.1$ R)AS: a. = ; <.4 =A> b. 9s ; <.4 $ d. 9s ; & $ b. =; <. =A> c. = ; <.
@.
a. b. c. d.
Por qu6 un inhibidor competiti7o no altera la =A>B Por qu6 un inhibidor no competiti7o simple no altera la $B Por qu6 un inhibidor incompetiti7o disminu+e tanto =A> como $B /n la inhibici3n no competiti7a mixta porqu6 la $ no permanece constanteB
C. *a catalasa descompone el D&E& unas 1
3
H. 'n experimento de cin6tica para la siguiente reacci3n catalizada por la an*i'rasa car"ónica: CO2
HCO3-
H2O
H+
9!E& (mmolesIlitro)
=o #1 (#1 + seg.) @ x 1< &< x 1< 1& x 1< @ x 1<
1.&4 &.4< 4.<< &<.<<
report3 los siguientes datos:
etermine ,M VMA(, a tra76s de los siguientes m6todos: a. 'sando la gr8fica de ichaelis # enten b. 'sando la gr8fica de *ineJea7er K %ur c. 'sando la gr8fica de /adie # Dofstee
?.
Rtas: $ ; 1< m.
= ; &.4 L1<#2 Iseg.
/l estu'io cin.tico de la hidr3lisis de un p6ptido con /ui!otri#sina, arroj3 los siguientes resultados: 9P/PTME () &.4 x 1<#2 4.< x 1<#2 1<.< x 1<#2 14.< x 1<#2
=o ( . min#1) &.& x 1<#@ .H x 1<#@ 4.? x 1<#@ C.1 x 1<#@
Calcule ,M VMA( de la reacci3n por dos de los tres m6todos del problema H.
Rtas$ $ ; 1.& x 1<# =A> ; 1.& x 1<#4 min#1
1<. /l estudio cin6tico de la reacci3n de 'esa!inación 'e 0-!etilas#artato en presencia de la respecti7a enzima, con sin in*i"i'or , produjo los siguientes datos:
1S2 () 1 x 1<#2 4 x 1<#2 1.4 x 1<# &.4 x 1<# 4 x 1<# a. b. c. d.
Vo 3sin I) (Iseg.)
<.<&@ <.
Vo 3con I4 (Iseg.) <.<1< <.<2< <.
/scriba con estructuras la reacci3n catalizada + d6 el no!"re de la enzima. isponga todos los datos en un gr8fico de Line5ea6er-Bur7. etermine $ + = para la reacci3n sin I + con I. Nustifique el ti#o 'e in*i"ición que ocurri3 + sugiera una estructura para el inhibidor.
Rta: = ; <.& Is
$ ; @.4 x 1<#2
4
11. !alcule el nFmero de recambio (,cat4 para la enzima (no inhibida) del problema anterior, sabiendo que se us3 1 x 1<#2 Omol de la misma. Rta: $cat ; & x 1
1&. -e efectFa un experimento de cin.tica en8i!tica + se calcula una VMA( de 1<< Omoles de producto por minuto. /n cada ensa+o se us3 <.1 ml de una soluci3n de enzima, con concentraci3n <.& mgIml. etermine la ,cat #ara la en8i!a, si su peso molecular es de 1&H.<<< gImol. Rta: 1<.C<< seg#1
1. -abiendo de qu6 manera afecta la presencia de un in*i"i'or co!#etiti6o los 7alores de $ + = de una enzima, trace en un mismo gr8fico tres l9neas que ilustren c3mo se diagnostica la inhibici3n competiti7a mediante el &or!ato 'e Ea'ie-:o&stee. 'se una l"nea para la reacci3n sin I, una segunda donde est6 presente I1, + una tercera donde halla I&. 9 M & es ma+or que 9 I 1. 12. 0ealice el problema 1 para la in*i"ición no co!#etiti6a si!#le. 14. 0ealice el problema 1 pero en el &or!ato 'e Line5ea6er-Bur7+ 1@. 0ealice el problema 1 para la inhibici3n aco!#etiti6a + en el &or!ato 'e L-B+ 1C. *a ,M 'e la in6ertasa es &.H x 1<#& . 5u6 &racción 'e la VMA( se obtendr8 con las siguientes concentraciones de sacarosaB a. b. c. d.
&.H x 1<#2 &.H x 1<# &.H x 1<#1 &.H
Rtas: b. = ; <. d. = ; <.?? =A>
1H. Para una enzima con un in*i"i'or no co!#etiti6o !i;to donde la $ disminu+e, elabore un gr8fico de *ineJea7er#%ur + otro de /adie#Dofstee, cada uno con dos l"neas: una para la reacci3n sin inhibidor + otra para la reacci3n con inhibidor. /n cada gr8fico nombre los interceptos + la pendiente. 1?. 0epita el ejercicio 1H para una enzima con un in*i"i'or no co!#etiti6o !i;to donde la $ aumente. &<. /n una reacci3n catalizada por una enzima, la presencia de 4 m de un in*i"i'or re6ersi"le produce un 7alor de 7elocidad m8xima (=A>) equi7alente al H< del 7alor en ausencia de M. $ no cambia. etermine el 7alor de $M. Rta: &
