TAXONOMIA Bacteriana

TAXONOMIA BACTERIANA

CONCEPTO Ciencia de la clasificación biológica Taxo axo:: Estr Estructu ucturació raciónn u or orden Nomos: Ley

PARTES Clasificación: Ubicación de los organismos en  grupos (taxones) en función de semejanzas y/o parentesco evolutivo Nomenclatura: Asigna los nombre de acuerdo a normas Identificación: Determina a que taxones pertenece un microor microorganismo ganismo aislado

IMPORTANCIA Ordena Or dena los conocimientos Permite hacer predicciones y formular hipótesis Establecer un lenguaje común y univer universal sal Caracterizar e identificar aislados Realizar Real izar estudios evolutivos

NO CONFUNDIR Taxonomía

•Estudio exhaustivo • Aplica teorías y

métodos de clasificación •Grupos taxonómicos •Nomenclatura

•Caracteriza por pruebas

Identificación

limitadas •Compara spp conocidas • Asigna una sp •No identificado: Estudio taxonómico

CONCEPTOS, CLASIFICACION Y RANGOS

RANGOS TAXONOMICOS Dominio

Phylum Clase Orden Familia Genero Importante en clínica y ecología

Especie

CLASIFICACION  A nivel de especie (sp) o subespecie (spp): Serovariedad o serotipo: Ag distintos Fagovariedad: tipificación por fagos Biovariedad: difer diferencias encias bioquímicas o fisiológicas Patovariedad: Patogenic atogenicidad idad Morfovariedad: Apariencia morfológica Genovariedad:: Grupos ADN similares Genovariedad

NOMENCLATURA Sistema binomial (Linneo): Staphylococcus intermedius Staphylococcus aur aureus eus S. intermedius S. aureus Streptococcus Str eptococcus sp

ESPECIE

Unidad taxonómica básica Grupo de cepas con alto grado de similitud y que difier difieren en de otro grupo de cepas Cepa: Población de organismos que desciende de un único or organismo ganismo o de una sola célula

ESPEECIE BAC ESP BACTERIANA TERIANA Homología mayor al 70% (Bergey’s Manual, 1984) Hoy, criteri criterioo Polifá Polifásico: sico: Fenotipo y  genotipo (incluye filogenético) Posible criterio futuro: Definición  genomica

Cepa Tipo: Primera cepa estudiada, siendo la mas caracterizada. No necesariamente es la representativa del grupo Existen bancos de cepas a nivel mundial Se tratan de mantener con el menor  numeroo de pases (subcultivos) numer

Centro de Colecciones Microbiologicas Centro (Facultad de Ciencias, UCV)Vzla.  American Type Culture Collection (ATTC), USA CIP (Coleccion Instituto Pasteur) Francia DSMZ, Alemania

Genero: Grupo definido de especies con muchas similitudes que estan claramente separados de otros  Actualmente muchas especies estan en estudio a raiz de nuevas evaluaciones

ESTUDIOS TAXONOMICOS

TAXONOMIA POLIFASICA Es la tendencia moderna Integra los caracter caracteres: es: Fenotipicos Genotipicos Filogenéticos

TAXONOMIA CLASICA Características fenotipicas También conocid conocidaa como como clasifi clasificación cación Fenética Porcentaje de G+C Ponderación de caracteres con con Claves Dicotómicas

CARACTERES FENOTIPICOS Morfológicas

Fisiológicas

CONTENIDO G+C Permite distinguir 2 organismos si difieren mas del 10%. Si tienen igual porcentaje, no funciona

TAX AXONOM ONOMIA IA NUM NUMERIC ERICAA Se utiliza para evaluar datos fenotipicos Utiliza gran numero de caracteres (>60) Cada dato tiene el mismo valor  Los caracteres comunes indican similitud entre especies

TAXO AXONOMI NOMIAA NUME NUMERIC RICAA

TAXO AXONOMI NOMIAA NUME NUMERIC RICAA Matrices de asociación

Grupos de similitudes

Dendogramas

TAXONOMIA MOLECULAR Basada en análisis análisis moleculares moleculares Técnicas utilizadas: Hibridación ADN-ADN Huella molecular (Molecullar  Fingerprinting)

HIBRIDACION Dependen de la secuencia Util en or organismos ganismos muy cercanos Criterio actual para definir especie Se basa en: Porcentaje de hibridac hibridación ión ADN-ADN ADN-ADN Temperatura de desnaturalización del híbrido

PROCEDIMIETO

HUELLA MOLECULAR Secuencias especificas de ADN Las mismas son sometidas a digestión con enzimas de restricción Su resolución resolución se ubica a nivel de subespecies

Fingerprinting 

CARACTERIZACION FILOGENÉTICA Evalúa la evolución

Se basa en la conservación de secuencias dentro de los genomas y su comparación con las variaciones que aparecen

CARACTERIZACION FILOGENÉTICA Plantea hipótesis de evolución, es decir, determina relaciones de parentesco entre especies Compara las secuencias de moléculas (cronómetros evolutivos) y establece la relación entre ellas Las secuencias de las moléculas son el registro histórico de la evolución

MOLECULAS UTILIZADAS  ARNr: 5S, 16S, 23S Subunidad beta de ATPasa RecA Factor de elongacion Tu Genes funcionales

RIBOSOMA

RIBOSOMA Esquema del  ARNr 16S

 ARBOL FILOGENÉTICO